GWAS揭示了Cercospora叶斑病原体中的一个快速演变的候选激烈效应因子
Chen Chen1, Harald Keunecke2, Felix Bemm2
1Plant Pathology Group, Institute of Integrative Biology, ETH Zurich, Zürich, Switzerland.
Molecular plant pathology
|November 27, 2023
概括
一个新发现的基因,AvrCR4,解释了Cercospora beticola如何克服甜菜的耐药性. 这一发现允许实时监测病原体种群,以有效管理Cercospora叶斑.
科学领域:
- 植物病理学 植物病理学
- 分子遗传学 分子遗传学
- 农业科学 农业科学
背景情况:
- 甜菜杂交品种具有BvCR4耐药基因,可对Cercospora叶斑病提供显著的保护.
- 能够克服这种耐药性的病原体菌株的出现需要了解潜在的遗传机制.
研究的目的:
- 调查Cercospora beticola菌株中毒性的遗传基础,这些菌株克服了BvCR4抗性基因.
- 为了确定负责破坏甜菜中BvCR4介导的耐药性的特定激烈基因.
主要方法:
- 实地试验是在自然和人工疾病压力下进行的,以评估病原体的毒性.
- 进行了256个C. beticola分离物的全基因组测序,并将其映射到新创建的参考基因组.
- 全基因组关联研究 (GWAS) 用于将遗传变异与毒性表型相关联.
主要成果:
- 发现了一种新型的毒性效应因子基因,AvrCR4,并与毒性相关.
- 病毒性分离物主要缺乏AvrCR4或在基因内具有突变.
- 在BvCR4耐药的甜菜杂交菌的分离物中经常观察到AvCR4的删除.
结论:
- 在最近出现的毒性C. beticola菌株中,AvrCR4是关键因素.
- 鉴定AvrCR4有助于对抗性突破菌株的病原体种群进行实时监测.
- 这一发现有助于在糖种植中对Cercospora叶斑的战略管理.
