宿主-寄生虫相互作用基因的古老多样性在一个模型的寄生虫线虫
Lewis Stevens1, Isaac Martínez-Ugalde2, Erna King3
1Tree of Life, Wellcome Sanger Institute, Hinxton, UK. ls30@sanger.ac.uk.
Nature communications
|November 27, 2023
概括
基因组分析揭示了Heligmosomoides线虫的明显进化,显示了通过平衡选择维持的古老,免疫相互作用的遗传变异. 这突出了宿主免疫压力塑造寄生虫基因组多样性的原因.
科学领域:
- 进化生物学 进化生物学
- 基因组学就是基因组学.
- 寄生虫学的寄生虫学
背景情况:
- 主体-寄生虫相互作用是进化变化的主要驱动力.
- 负频率依赖选择被假设是为了保持免疫和抗原位置的遗传多样性.
- 在许多宿主寄生系统中观察到高多态度水平.
研究的目的:
- 为了研究Heligmosomoides bakeri和Heligmosomoides polygyrus的基因组分离和进化史.
- 为了确定由寄生性线虫中的宿主免疫选择压力所塑造的遗传因素.
- 探索平衡选择在维持基因组多样性的作用.
主要方法:
- 来自Heligmosomoides bakeri和Heligmosomoides polygyrus的多个个体的基因组测序.
- 进行比较基因组分析,以评估分歧并识别超分歧的单元类型.
- 对编码参与宿主免疫相互作用的蛋白质的基因的分析.
主要成果:
- Heligmosomoides bakeri和Heligmosomoides polygyrus基因组显示出显著的分歧,表明至少有一百万年的独立进化.
- 这两种物种都具有富含宿主免疫相互作用蛋白质的超分歧单元型.
- 许多这些单元类型早于物种分化,这表明长期的平衡选择.
结论:
- 主体免疫反应对寄生性线虫基因组施加了相当大的选择压力.
- 长期的平衡选择保持了参与宿主免疫逃避的超分歧单元类型.
- 这些线虫中的基因组多样性模式在很大程度上是由宿主-寄生虫共同进化形成的.
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