从使用MiXCR的免疫谱系测序数据推断出超敏感的等位基因推断
bioRxiv : the preprint server for biology
|November 28, 2023
概括
这项研究引入了一种新的算法,用于从测序数据中精确的适应性免疫受体基因的基因定型. 这些发现揭示了不同人群中免疫受体位点的遗传多样性.
科学领域:
- 免疫学 免疫学 免疫学
- 遗传学 是一个遗传学.
- 生物信息学是一种生物信息学.
背景情况:
- 适应性免疫受体位点,编码B细胞和T细胞受体 (BCR/TCR),表现出对免疫反应至关重要的等位变异性.
- 受体谱系测序 (Rep-Seq) 是研究免疫球蛋白 (IG) 和T细胞受体 (TR) 位点在不同人群中的等位基多样性的关键方法.
结论:
- 开发的算法促进了免疫受体等位基多样性的全面分析.
- 已经建立了一个公开可访问的数据库 (https://vdj.online) 推断V和J基因等位基因变异及其种群频率.
- 本资源有助于理解适应性免疫的种群遗传学,并发现新的免疫受体等位基因.
