狗尿癌:在固定在甲,嵌入在氨酸的组织样本和正常尿液中检测微RNA的试点研究
Mara S Varvil1, Samuel L Clark1, Taylor W Bailey1
1Department of Comparative Pathobiology, College of Veterinary Medicine, Purdue University, West Lafayette, IN, USA.
概括
甲林的固定时间没有影响尿癌组织中微RNA (miRNA) 的量化. 然而,包括膀肌肉组织改变了miRNA配置文件. 尿液miRNAs在两周内保持稳定,支持使用储存样本用于miRNA检测.
科学领域:
- 兽医病理学 兽医病理学
- 分子生物学分子生物学
- 生物化学 生物化学
背景情况:
- 微RNAs (miRNAs) 是尿癌 (UC) 的关键生物标志物.
- 固定在形式素,嵌入式 (FFPE) 组织和尿液样本通常用于miRNA分析.
- 预分析条件的标准化对于可靠的miRNA量化至关重要.
研究的目的:
- 为了评估甲素固定时间和组织纳入对FFPE UC样本中miRNA量化的影响.
- 在各种存储条件下评估尿液中miRNA的稳定性.
- 为FFPE组织和尿液中miRNA分析提供建议.
主要方法:
- 从FFPE尿路癌和正常的膀组织中提取了MiRNA,包括肌肉.
- 尿样被采集并存储在不同的温度和时间.
- 使用逆转录定量实时PCR (RT-qPCR) 来量化特定的miRNAs (miR-143,miR-152,miR-181a,miR-214,miR-1842,RNU6B),并使用miR-39作为对照.
主要成果:
- 甲林固定时间没有显著改变miRNA循环量化 (Cq) 值.
- 将肌肉层纳入FFPE膀组织中,导致miR-152,miR-181a和RNU6B的miRNA Cq概况在统计上不同.
- 无细胞尿中的miRNA保持稳定长达两周,无论储存温度如何.
结论:
- 储存的FFPE组织和尿液样本适合用于miRNA检测.
- 建议在FFPE段中专门测量miRNAs在感兴趣的组织内,以避免混结果.
- 样品处理的标准化协议对于准确的miRNA生物标志物研究至关重要.
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