使用免疫基因组学方法对猪对古典猪瘟疫苗接种的免疫反应产生影响的新型SNP的阐明
Satish Kumar1,2, Bharat Bhushan3, Amit Kumar4
1Division of Animal Genetics, ICAR-Indian Veterinary Research Institute, Izatnagar, Bareilly, U.P, 243122, India. hilsa.satis2007@gmail.com.
Veterinary research communications
|November 28, 2023
概括
主体遗传学会影响小猪对CSF疫苗接种的免疫反应. 全基因组关联研究确定了与抗体水平相关的猪染色体上的特定SNP,有助于培育更好的抗病能力.
科学领域:
- 动物遗传学动物遗传学
- 免疫学 免疫学 免疫学
- 兽医医学 兽医医学 兽医医学
背景情况:
- 主体的遗传构成显著影响个体对品种内疫苗接种的免疫反应.
- 了解遗传变异对于改善牲畜群体的抗病能力至关重要.
研究的目的:
- 为了阐明在Landlly小猪中对古典猪瘟 (CSF) 疫苗接种的差异性免疫反应的遗传基础.
- 为了确定与高和低幽默免疫反应相关的特定遗传标记.
主要方法:
- 对CSF疫苗接种的E2抗体反应被测量为幽默免疫反应指标.
- 与双重消化限制相关的DNA (ddRAD) 测序在96只Landlly小猪身上进行.
- 全基因组关联研究 (GWAS) 使用PLINK进行,以确定显著的SNP标记物.
主要成果:
- 确定了与脑疫苗接种E2抗体反应相关的显著单核酸多态 (SNP) 标志物.
- 有信息性的SNP位于猪染色体SSC10,SSC17,SSC9,SSC2,SSC3和SSC6.6上.
- 在显著的SNP附近发现了CYB5R1,WT1和TLR6等基因,这表明它们在免疫功能中的作用.
结论:
- 主体遗传构成与Landlly小猪中CSF疫苗接种的差异性免疫反应有关.
- 识别的信息性SNP可以作为预测宿主免疫反应对CSF疫苗接种的变异的标记.
- 这项研究提供了对猪免疫反应的遗传结构的见解,可能有助于选择性育种计划.


