从全血转录基因组进行的反应体通路分析揭示了在临床前阶段系统性硬化症患者的独特特征
Chiara Bellocchi1,2, Xuan Wang3, Marka A Lyons4
1Department of Clinical Sciences and Community Health, University of Milan, Milan, Italy.
Frontiers in immunology
|November 29, 2023
概括
临床前系统性硬化症 (PreSSc) 显示出不同的途径标志. 疾病进展涉及信号传导的变化,特别是与相关的事件,可能导致内皮损伤和血管病变.
科学领域:
- 免疫学和风湿病学
- 分子生物学和遗传学
- 系统生物学 系统生物学
背景情况:
- 临床前系统性硬化症 (PreSSc) 的特点是雷诺现象,自身抗体和毛细管镜检查结果.
- 了解PreSSc中的分子通路对于预测疾病进展至关重要.
- 早期识别生物标志物可以帮助及时干预系统性硬化症 (SSc).
研究的目的:
- 在患有PreSSc.的受试者中描述差异表达路径 (DEP).
- 在PreSSc.中识别与疾病进展相关的分子特征.
- 探索特定途径在从预SSc过渡到确定的SSc中的作用.
主要方法:
- 在33名PreSSc受试者和16名健康对照者 (HC) 中使用RNA测序进行全血转录组分析.
- 使用ANOVA对Reactome路径的功能注释和DEP的识别.
- 有内部验证的物流回归模型来评估DEP的预测能力.
主要成果:
- 在基线时,541个DEP区分了PreSSc和HC (AUROC=0.792).
- 疾病进展 (42.4%的受试者) 与生物特征的显著变化有关.
- 进展与信号转导途径的变化相关,包括与有关的事件和异醇1,4,5-三酸盐代谢.
结论:
- 与HC相比,PreSSc表现出不同的Reactome路径签名.
- 到明确的SSc的进展涉及分子途径的动态转变.
- 与相关的事件可能在SSc进展期间在内皮损伤和血管病变中发挥重要作用.


