多omics分析揭示了与乳腺癌有关的DNA损伤修复相关的集群,并通过实验验证验证
Peng Liu1, Xinpei Deng1, Huamao Zhou2
1State Key Laboratory of Oncology in South China, Guangdong Provincial Clinical Research Center for Cancer, Sun Yat-sen University Cancer Center, Guangzhou, China.
Frontiers in immunology
|November 29, 2023
概括
乳腺癌 (BC) 呈现出不同的DNA损伤修复 (DDR) 模式. 一个DDR抑制的集群显示出更好的生存率,而一个DDR活跃的集群表明BC患者的攻击性行为和较差的预后.
科学领域:
- 在瘤学瘤学.
- 遗传学 遗传学 是一个
- 分子生物学分子生物学
背景情况:
- 乳腺癌 (BC) 是一种具有显著分子异质性的常见恶性瘤.
- 在BC中DNA损伤修复 (DDR) 的作用和异质性仍然不完全理解.
研究的目的:
- 用多维数据来描述乳腺癌 (BC) 中的DNA损伤修复 (DDR) 特性.
- 研究BC中DDR异质性的临床和分子含义.
主要方法:
- 利用了从公共数据集 (SCAN-B,METABRIC,TCGA-BRCA) 中的转录组学,基因组学和单细胞转录组分析.
- 收集了276个DDR相关基因,并分析了大量和单细胞RNA测序数据.
- 开发并验证了用于分类BC患者的DDR得分.
主要成果:
- 确定了两个不同的群体:DDR抑制 (更高的生存率) 和DDR活性 (预后较差,攻击性行为).
- 在多个队伍中验证了DDR分类,揭示了差异性路径活动.
- 发现恶性细胞和免疫抑制性免疫细胞 (例如FOXP3+ CD4+ T细胞) 对DDR得分有显著的贡献.
结论:
- 这项研究阐明了乳腺癌 (BC) 中的DNA损伤修复 (DDR) 的异质性.
- 提供了个人化分子和临床病理机制的见解,这些机制是不同的DDR配置文件的基础.
- 突出了PRAME在BC DDR中的潜在作用以及特定细胞类型对DDR得分的贡献.
