在生物信息学的指导下,发现了双结合的拉索
Hamada Saad1,2, Thomas Majer1, Keshab Bhattarai1
1Department of Pharmaceutical Biology, Institute of Pharmaceutical Sciences, University of Tübingen Auf der Morgenstelle 8 72076 Tübingen Germany hamada.saad@pharm.uni-tuebingen.de harald.gross@uni-tuebingen.de.
Chemical science
|November 29, 2023
概括
研究人员发现了具有独特交叉链接和修改的新型拉索,包括前所未有的S-甲基化. 这些发现扩大了已知的核糖体合成和翻译后修饰 (RiPPs) 的多样性.
科学领域:
- 自然产品化学 自然产品化学
- 生物化学 生物化学
- 微生物学 微生物学
背景情况:
- 拉索是一种由核糖体合成和翻译后改性 (RiPPs) 的类,其特征是具有异酸键和拉里亚.
- 二次修饰进一步使拉索结构多样化,但新的修饰在很大程度上仍未被探索.
研究的目的:
- 发现和结构性地描述具有独特修饰的新型拉索.
- 调查与这些新型拉索相关的生物合成基因集群 (BGCs).
主要方法:
- 基因组挖掘用于识别含有细胞染色体P450基因的拉索BGC.
- 质谱学,稳定同位素结合和2D-NMR光谱学用于结构阐明.
- 鉴定化合物的生物活性选.
主要成果:
- 发现了两种独特的 (C-N) 双连接拉索:nocapeptin A (Trp-Tyr交叉连接) 和longipepetin A (Trp-Trp连接).
- 在longipepetin A中发现一种新型的S-甲基化 metionin,形成三价硫 - - 一种以前未被描述的RiPP修饰.
- 诺卡佩A对*Micrococcus luteus*表现出适度的抑制生长活性.
结论:
- 这项研究揭示了拉索的前所未有的结构多样性,包括新的交叉链接和翻译后修改.
- 已识别的BGC为未来对P450修饰的拉索的表征提供了基础.
- 这项工作扩大了RiPPs的化学空间,并突出了发现新生物活性天然产品的潜力.
