在无脊椎动物食物网研究中测试不同洗方案的有效性,以去除身体表面污染物
Melissa Jüds1, Kerstin Heidemann1, Bernhard Eitzinger1,2
1J. F. Blumenbach Institute of Zoology and Anthropology, Georg-August Universität Göttingen, Göttingen, Germany.
PeerJ
|November 29, 2023
概括
表面去污染对于微关节动物中精确的分子肠道含量分析至关重要. 漂白剂有效地去除真菌污染物而不损害猎物DNA检测,使可靠的饮食研究.
科学领域:
- 生态生态学 生态生态学
- 分子生物学分子生物学
- 土壤科学 土壤科学
背景情况:
- 分子肠道含量分析对于理解食相互作用至关重要,特别是在土壤微关节动物中.
- 在微关节动物中提取全身DNA可能会错误地将表面污染物识别为摄入的食物.
- 胞是常见的表面污染物,可能导致不准确的饮食评估.
研究的目的:
- 评估微关节动物的十种表面消毒方法.
- 确定一种有效去除真菌污染物的方法.
- 为了确保除污染不会干扰被摄入的猎物DNA的检测.
主要方法:
- 使用 *Steganacarus magnus* (oribatid虫) 作为一个模型生物体.
- 用线虫 (*Plectus* sp.) 食虫的方法 并将它们污染成真菌子 (*Chaetomium globosum*).
- 使用诊断PCR检测猎物和污染物DNA,在应用了十种除污方法后,包括漂白剂.
主要成果:
- 漂白剂 (5%的甲) 在去除真菌表面污染方面表现出最高的效率.
- 用漂白剂去污没有显著影响到猎物DNA的检测.
- 其他经过测试的方法在有效性和对猎物DNA检测的潜在影响方面各不相同.
结论:
- 在微关节动物的分子肠道含量分析中,建议使用5%的二溶液进行有效的身体表面净化.
- 该协议通过将表面污染物的错误阳性结果降到最低,提高了饮食研究的准确性.
- 这些发现提供了一种标准化的方法,用于对土壤无脊椎动物的可靠猎物频谱分析.
