通过微剖析提高瘤含量和瘤细胞数量,有助于下一代测序器更高地检测基因突变
Akihiro Tamiya1, Kensuke Kanaoka1, Yuji Inagaki1
1Department of Internal Medicine, National Hospital Organization Kinki-Chuo Chest Medical Center, Osaka, Japan.
Heliyon
|November 29, 2023
概括
微切割通过增加瘤细胞含量,显著提高了晚期肺癌中遗传突变检测率. 这种技术增强了下一代测序分析,用于个性化治疗策略.
科学领域:
- 在瘤学瘤学.
- 基因组学就是基因组学.
- 分子诊断学 分子诊断
背景情况:
- 下一代测序 (NGS) 对于高级肺癌治疗至关重要.
- 小型活检通常缺乏足够的瘤细胞来准确进行NGS分析.
- 微切割隔离瘤细胞,增加样本瘤含量.
研究的目的:
- 评估微切割对遗传突变检测率的影响.
- 为了确定瘤含量增加是否会改善下一代测序 (NGS) 分析结果.
- 评估微解剖在优化瘤活检样本用于遗传测试中的实用性.
主要方法:
- 追溯性研究,比较在微剖切实施前和之后的Oncomine Dx目标测试 (ODxTT) 结果.
- 两组:A组 (没有微切割) 和B组 (有微切割).
- 基于ODxTT提交的预定义瘤含量和细胞计数标准的突变检测率的比较.
主要成果:
- 总共有214个病例被分析 (112个在A组,102个在B组).
- 在B组 (58%) 的基因突变检测率明显高于A组 (35%) (P=0.0006).
- 在B组中观察到关键基因的检测率增加,包括EGFR,KRAS和MET.
结论:
- 通过微切割增强瘤细胞数量和含量可以提高基因突变检测率.
- 微解剖是优化瘤样本用于肺癌分子分析的一个有价值的技术.
- 这种方法可以带来更全面的遗传信息,以指导治疗决策.
