在伊拉克克尔巴拉使用小子单元rRNA基因序列对Candida albicans和C. dubliniensis进行分子鉴定
M Taqi Al-Khazali1, B Mousa Hassan2, S Ahmed AbedIbrahim3
1Department of Biology, College of Science, University of Kerbala, Kerbala, Iraq.
Archives of Razi Institute
|November 29, 2023
概括
这项研究证实了使用18SrRNA基因测序的Candida albicans和Candida dubliniensis的口腔候群病诊断. 基因分析显示,与全球菌株有很高的相似性,有助于准确的物种识别.
科学领域:
- 医学真菌学 医学真菌学
- 分子生物学分子生物学
- 遗传学 遗传学 是一个
背景情况:
- 口腔角膜炎通常是由Candida物种引起的.
- 准确识别Candida物种对于有效治疗至关重要.
- 以前对Candida菌株的隔离需要进一步的诊断确认.
研究的目的:
- 为了确认Candida albicans和Candida dubliniensis的表型诊断.
- 用分子技术对这些分离物进行基因鉴定.
- 将遗传序列与现有的数据库进行比较以进行识别.
主要方法:
- 聚合酶连锁反应 (PCR) 放大了18S rRNA基因.
- 放大18SrRNA产物的DNA测序.
- 与NCBI数据库对比的基本本地对齐搜索工具 (BLAST) 分析.
- 与全球Candida菌株的序列比较.
主要成果:
- 这项研究证实了Candida albicans和Candida dubliniensis的存在.
- 坎迪达阿尔比坎斯菌株与全球分离物有99%的相似性.
- 坎迪达杜布利尼尼尼斯菌株与国际菌株具有99%的遗传相似性.
- 在物种之间发现了序列变异,包括三种和两种突变.
- 研究菌株被存入GenBank (加入代码MZ574137和MZ574410.1).1) 进行研究.
结论:
- 获得了Candida albicans和Candida dubliniensis的分子确认.
- 与全球菌株的高度遗传相似性凸显了18S rRNA测序对Candida识别的有用性.
- 鉴定的序列变异有助于了解这些物种内的遗传多样性.
