通过从植入前遗传测试中采用超低覆盖范围的全基因组测序来确定胚胎无体积的风险变异
Siqi Sun1, Mansour Aboelenain2, Daniel Ariad3
1Department of Genetics, Rutgers, The State University of New Jersey, Piscataway, NJ, USA.
American journal of human genetics
|November 29, 2023
概括
遗传因素影响无卵子卵子的产生,这是IVF失败的原因之一. 这项研究确定了一种与介质性形积分症风险相关的基因,提供了对孕产妇不孕症原因的见解.
科学领域:
- 遗传学 遗传学 是一个
- 生殖生物学 生殖生物学
- 基因组医学是基因组医学.
背景情况:
- 染色体数异常 (aneuploidy) 是早期流产和体外受精 (IVF) 失败的主要原因.
- 在接受试管婴儿的个体中,无卵性卵子生产的变化表明存在潜在的遗传因素,但这些因素在很大程度上仍然未知.
- 胚胎活检 (PGT-A) 提供了宝贵的胚胎活检数据.
研究的目的:
- 通过分析PGT-A数据,研究无卵性卵子生产的遗传基础.
- 识别与胚胎形症风险相关的父母基因组中的遗传变异.
- 为了功能验证参与介质性无体积变异的候选基因.
主要方法:
- 利用了来自约10,000个PGT-A活检的超低覆盖全基因组测序 (ulc-WGS) 数据.
- 在胚胎基因组中的遗传变异的输入基因型概率.
- 进行了一项全基因组关联研究 (GWAS),使用归算变异和无体病调用对无体病发病率进行了研究.
- 在小鼠卵细胞模型中对候选基因进行功能评估.
主要成果:
- 鉴定出3号染色体上的一个显著的位点,与中性动脉积症风险相关.
- 确定CCDC66作为这个位点内的候选基因,涉及在半变异过程中染色体分离.
- 证明了CCDC66在调节小鼠卵细胞中中性进展和染色体分离忠实性的作用,特别是在老年人中.
结论:
- 可以利用PGT-A-WGS数据进行强大的遗传关联研究.
- CCDC66是一种新型遗传因子,有助于孕产妇中介性形积分症的风险.
- 这项研究增强了对不孕不育的遗传基础的理解,并为未来的基因组关联研究提供了可概括的方法.
