毛细血管上化微反应器:在同一个单细胞中进行蛋白质代谢形的简单策略
Yingyun He1,2, Huiming Yuan1, Yu Liang1
1CAS Key Laboratory of Separation Science for Analytical Chemistry, National Chromatographic Research and Analysis Center, Dalian Institute of Chemical Physics, Chinese Academy of Sciences Dalian 116023 China huimingyuan@dicp.ac.cn lihuazhang@dicp.ac.cn.
Chemical science
|November 30, 2023
概括
一个新的毛细血管上化微反应器 (OCAM) 能够在单细胞中同时进行蛋白质代谢概况. 这种方法提高了分析生物和疾病状态中的细胞异质性的效率.
科学领域:
- 生物化学 生物化学
- 细胞生物学 细胞生物学
- 分析化学 分析化学
背景情况:
- 单细胞多组体分析为细胞异质性提供了深入的见解.
- 在同一个单细胞内测量蛋白质组和代谢组是具有挑战性的,因为缺乏放大技术.
研究的目的:
- 开发一种新的方法,在单细胞中同时进行蛋白质代谢形.
- 为了克服当前低输入蛋白质组样本准备的局限性.
主要方法:
- 开发一种新的毛细管上化微反应器 (OCAM).
- 蛋白质通过硫烯基化结合,然后通过代谢物化和柱状蛋白质消化进行共聚结合.
- OCAM使用了一种具有酸功能的开放管状毛细血管微反应器.
主要成果:
- 与现有方法相比,OCAM显示了更好的效率,抗干扰和恢复.
- 在单个HeLa细胞中平均发现了1509个蛋白质组.
- 在小鼠卵细胞中,确定了3457个蛋白质组和171个代谢物,实现了迄今为止最深入的覆盖范围.
结论:
- 该OCAM策略使单细胞蛋白质代谢组的全面分析成为可能.
- 这种方法提供了在卵细胞成熟期间代谢模式的补充性特征.
- 在正常和疾病生理学中,OCAM技术促进了细胞对细胞异质性的研究.
