儿童败血症的与溶酶相关的诊断生物标志物被机器学习集成
1Department of Nuclear Medicine, Henan Provincial People's Hospital, People's Hospital of Zhengzhou University, People's Hospital of Henan University, Zhengzhou, Henan, 450003, People's Republic of China.
Journal of inflammation research
|November 30, 2023
概括
使用 lysosomal 基因的新四基因模型准确地识别了儿科败血症. 这种诊断工具对早期检测和毒症儿童的潜在治疗点有希望.
科学领域:
- 基因组学就是基因组学.
- 分子诊断学 分子诊断
- 儿童传染病 儿童传染病
背景情况:
- 目前没有可靠的生物标志物用于毒症诊断,这阻碍了及时干预.
- 溶解体基因代表了识别败血症的潜在途径,特别是在儿科病例中.
- 这项研究系统地评估了儿科败血症中 lysosomal 基因的诊断价值.
研究的目的:
- 开发和验证使用 lysosomal 基因的儿科败血症诊断模型.
- 确定可以作为儿科败血症生物标志物的关键溶解体基因.
- 将拟议模型的诊断疗效与传统的炎症标志物进行比较.
主要方法:
- 从基因表达总量 (GEO) 数据库中使用了三个基因表达数据集 (GSE13904,GSE26378,GSE26440).
- 采用LASSO和随机森林分析来选关键的溶酶体基因并构建诊断模型.
- 在临床样本上使用接收器操作特征 (ROC) 曲线分析和实时定量PCR (qRT-PCR) 验证了模型的性能.
主要成果:
- 为诊断模型确定了四个关键的 lysosomal 基因 (STOM, VNN1, SORT1, RETN).
- 这四种基因在所有评估队列中的儿科败血症患者中表达得始终更高.
- 诊断模型实现了高诊断性能,曲线下的面积 (AUC) 值从0.917到1不等,超过了PCT,WBC,CRP和NEU%等传统标记.
结论:
- 一个强大的四基因诊断模型基于 lysosomal 基因功能的儿科败血症已经开发和验证.
- 这种模型显示了儿童败血症准确和早期检测的巨大潜力.
- 这些已识别的基因可能会成为儿科败血症管理中溶酶体干预的新型治疗点.
