评价crAssphage作为人类便来源跟踪标记在下面的大湖
Enze Li1, Faizan Saleem1, Thomas A Edge1
1Department of Biology, McMaster University, Ontario L8S 4L8, Canada.
The Science of the total environment
|November 30, 2023
概括
人类肠道菌体Crassphage有效地表明大湖水中的人类便污染. 该ORF18-mod标记基因表现出高灵敏度和特异性,在超过一半的样本中检测到污染,特别是在降雨后.
科学领域:
- 环境微生物学环境微生物学
- 水质监测 监测水质 监测水质
- 微生物源追踪 微生物源追踪
背景情况:
- CrAssphage是人类肠道中最丰富的菌体,也是人类便污染的敏感指标.
- 它在大湖地区的实用性,这是一个关键的水系统,需要进一步调查.
- 区分人类和非人类便来源对于有效的水资源管理至关重要.
研究的目的:
- 评估crAssphage在大湖地区作为人类便指标的适用性.
- 使用qPCR测试两个crAssphage标记基因 (ORF18-mod和CPQ_064) 的疗效.
- 评估在休水域和相邻河口的crAssphage流行率和度.
主要方法:
- 量化聚合酶链反应 (qPCR) 用于检测和量化两个crAssphage标记基因.
- 从多伦多的休海及其相邻的河口收集了样本.
- 确定了人类的敏感性和标记基因的特异性.
主要成果:
- 这两种标记基因都表现出高的人类特异性 (100%).
- 人类敏感性为CPQ_064的71.4%和ORF18-mod的100%.
- 在57.7%至71.2%的环境水样中检测到Crassphage,与海相比,河流的流行率和度更高.
- 在环境样本中,ORF18-mod显示出更高的检测率和灵敏度.
- CrAssphage存在与降雨相关,并在2021年6月和7月更频繁地检测到.
结论:
- CrAssphage,特别是ORF18-mod标记物,是大湖娱乐水域人类便污染的可靠指标.
- 河流是人类便污染到达海的重要途径.
- CrAssphage检测可以帮助区分人类驱动大肠杆菌和肠球菌在海上增加的来源,特别是受到河流潮的影响时.
