全基因组检测体质马赛克主义在短串联重复的重复
Aarushi Sehgal1, Helyaneh Ziaei-Jam1, Andrew Shen1
1Department of Computer Science and Engineering, University of California San Diego, La Jolla, USA.
bioRxiv : the preprint server for biology
|December 4, 2023
概括
一种名为prancSTR的新方法,可以从测序数据中识别马赛克短并列重复 (mSTR),而不需要对照样本. 这有助于更好地了解与STR不稳定性相关的疾病.
科学领域:
- 基因组学就是基因组学.
- 人类遗传学 人类遗传学
- 生物信息学是一种生物信息学.
背景情况:
- 阴性马赛克主义,后阳性突变,与发育障碍和癌症有关.
- 短串联重复 (STR) 在重复扩张障碍和癌症微卫星不稳定性方面至关重要.
- 现有的工具缺乏用于识别马赛克STR (mSTR) 的系统方法.
结论:
- prancSTR提供了一种新的,可访问的方法来系统地识别mSTR.
- 这些发现表明,STR不稳定率在个人之间存在显著差异.
- 这项工作有助于研究与STR位点体质马赛克相关的疾病.


