连续和完整的细胞囊与肠道微生物组相关的原生体组合揭示了进化多样化的宿主生态

科学领域:

• 微生物学 微生物学
• 进化生物学 进化生物学
• 基因组学就是基因组学.

背景情况:

• 胚囊体是人类肠道中最常见的微生物真核生物,从自由生活的祖先演化过渡的理解不佳.
• 这种原生体在多样化的脊椎动物宿主中分布广泛,表明了显著的适应潜力.

研究的目的:

• 为了研究胚胎细胞的进化过渡和遗传多样性.
• 探索不同宿主相关血统的胚胎细胞的基因组和代谢适应.

主要方法:

• 使用长读,短读和Hi-C DNA 测序培养和测序八种不同的胚胎囊菌株.
• 使用了对比基因组分析,基因注释和RNA测序.

主要成果:

• 在Blastocystis菌株中观察到基因含量和基因组结构的显著变异.
• 来自乌的菌株表现出更大的基因组,保留了正规的停止编码子,与与人类相关的菌株不同.
• 所有分离物体都显示了与细胞复杂性降低相关的基因损失,而乌菌株拥有植物碳水化合物代谢酶,其中一些从细菌中水平获得.

结论:

• 囊胚表现出大量的遗传和代谢多样性,反映了宿主肠道中各种生态作用.
• 横向基因转移在胚胎囊适应不同宿主方面发挥着作用.
• 基因丢失有助于减少细胞复杂性.