识别分子亚型和基于低级质瘤患者炎症相关基因的风险模型
Cheng Long1, Ya Song1, Yimin Pan2
1Department of Orthopedics, Xiangya Hospital, Central South University, Changsha, 410008, China.
Heliyon
|December 4, 2023
概括
与炎症相关的基因 (IRG) 对低级质瘤 (LGGs) 有影响. 研究人员确定了245个IRG,并开发了一种10基因风险模型,可以预测LGG患者的预后和化疗反应.
科学领域:
- 神经瘤学神经瘤学
- 癌症基因组学 癌症基因组学
- 免疫学 免疫学 免疫学
背景情况:
- 低级质瘤 (LGGs) 具有侵入性和异质性,患者的结局可能会变化.
- 透性炎症细胞和与炎症相关的基因 (IRG) 越来越多地被认为是它们在各种癌症的瘤发生,预后和治疗反应中的作用.
- 在LGG中IRG的具体作用在很大程度上仍未定义.
研究的目的:
- 调查LGG中IRG的预后意义.
- 在LGG中识别与炎症相关的分子亚型.
- 为LGG患者开发和验证基于IRG的预后风险模型.
主要方法:
- 利用癌症基因组图谱 (TCGA) 队列来识别与LGG预后相关的IRG.
- 进行无监督的集群分析来定义分子亚型.
- 使用十个关键的IRG构建和验证了一个预测风险模型.
主要成果:
- 确定了245个与LGG临床预后相关的IRG.
- 发现了两个不同的与炎症相关的分子集群,具有不同的免疫微环境,瘤发生和干度指数.
- 开发了一种10基因预后风险模型,可以独立预测LGG患者的存活率,并与免疫细胞透,瘤突变负担,HLA/免疫检查点基因表达和干性相关联.
结论:
- 已识别的IRG和开发的风险模型为LGG炎症的作用提供了有价值的见解.
- 预后风险模型可以预测患者的结果和潜在的化疗反应.
- 这项研究支持对LGG进行个性化治疗策略的发展.
