伪虫虫 sp. 虫虫 Nov.,从潮平面沉积物中分离出来
Han Sol Kim1,2, Min Kuk Suh1,2, Ji-Sun Kim1
1Korean Collection for Type CulturesKorea Research Institute of Bioscience and Biotechnology(KRIBB), Jeongeup-si, 181 Ipsin-gil, Jeollabuk-do 56212, Republic of Korea.
International journal of systematic and evolutionary microbiology
|December 4, 2023
概括
两种新型细菌菌株,Pseudomonas aestuarii SA3-5T和SA3-6,从韩国的潮平面中确定. 这些有氧,运动细菌代表了Pseudomonas属内的新物种,扩大了微生物多样性知识.
科学领域:
- 微生物学 微生物学
- 细菌学 细菌学是一门学科.
- 纳税学是一种分类学.
背景情况:
- 海洋潮平面是微生物多样性的丰富储库.
- 类 Pseudomonas 包含各种各样的物种,具有重要的生态和生物技术作用.
研究的目的:
- 从韩国潮平面 (getbol) 中分离和描述新型细菌菌株.
- 通过多相性表征来确定孤立菌株的分类属性.
- 在 Pseudomonas 属内提出一种新物种.
主要方法:
- 从潮平坦沉积物中分离细菌菌株.
- 多相表征包括16S rRNA基因测序,平均核酸标识 (ANI) 和数字DNA-DNA杂交 (dDDH).
- 对表型特征,化学分类学概况 (脂肪酸组成,呼吸系统) 和DNA G+C含量的分析.
主要成果:
- 两种新型菌株SA3-5T和SA3-6被确定为格拉姆阴性,有氧,运动棒.
- 基于16S rRNA基因序列的家族遗传学分析显示,菌株之间100%的相似性和与Pseudomonas taeanensis的高度相似性 (98.3%).
- ANI和dDDH值低于新物种划分的门值,支持将其归类为新物种.
- 化学分类学数据显示主要脂肪酸C16:1ω6c/C16:1ω7c (总结特征3),C16:0,C18:1ω6c/C18:1ω7c (总结特征8),其中Q-9是主要的呼吸.
- 菌株SA3-5T的DNA G+C含量为62.5 mol%.
结论:
- 菌株SA3-5T和SA3-6代表了Pseudomonas属的一种新型物种.
- 这种新物种的拟议名称是Pseudomonas aestuarii sp. 在新的一年里.
- 类型菌株是SA3-5T (KCTC 92395T = JCM 35697T). 这种菌株的类型是SA3-5T (KCTC 92395T = JCM 35697T).
