后转录调节塑造了静止芽发酵酵母的转录组
Alison C Greenlaw1,2, Kris G Alavattam1, Toshio Tsukiyama1
1Basic Sciences Division, Fred Hutchinson Cancer Center, Seattle, WA 98109, USA.
细胞通过沉默转录进入静止状态,但新的非编码RNA (ncRNA) 增加. 核外体通路调节mRNA和ncRNA的丰富性,这对于高效的细胞循环结束至关重要.
科学领域:
- 细胞生物学 细胞生物学
- 分子生物学分子生物学
- 基因规则 基因规则
背景情况:
- 细胞必须进入静止状态才能长期存活,这涉及细胞周期的退出和可逆的不复制.
- 发芽的酵母重新编程基因表达,在静止进入期间使转录沉默.
- 在静止进入期间新生转录组的变化在很大程度上是未知的.
研究的目的:
- 为了研究酵母静止期进入期间新生转录组的变化.
- 识别新型非编码RNA (ncRNA) 并了解它们在静止过程中的作用.
- 阐明静止细胞中转录后调节的机制.
主要方法:
- 在静止和G1酵母细胞中使用RNA测序对新生转录组的分析.
- 研究核外体-NNS通路在调节mRNA和ncRNA丰度中的作用.
- 在静止期进入期间的时间过程RNA测序.
主要成果:
- 在静止和G1酵母细胞中确定了超过一千个ncRNA,ncRNA转录在静止中更为突出.
- 与G1相比,信使RNA (mRNA) 和ncRNA在静止状态下表现出增加的转录后调节.
- 核外体-NNS通路在静止状态下抑制了超过一千个mRNA和正规的ncRNA.
- 确定了两个关键时间点,其中核外体调节mRNA丰富性,用于蛋白质生产,细胞组织和静态进入期间的新陈代谢.
结论:
- 核外体-NNS通路在静止期间的mRNA调节中发挥了以前未知的作用.
- 在静止状态中发现了一种新的基因表达控制层,涉及核外体的转录后调节.
- 通过核外体对特定mRNA群体的控制,可以有效地进入静止状态.
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