在野外采集的床虫中对病毒进行了metatranscriptomic评估

科学领域:

• 病毒学 病毒学
• 昆虫学 昆虫学是一门学科.
• 分子生物学分子生物学

背景情况:

• Cimex lectularius (常见的床) 是一个流行的人类外寄生虫和城市害虫.
• 使用现代分子技术,对床现场种群中的微生物进行的研究有限.
• 床目前并不是人类传染病的已知载体.

研究的目的:

• 调查一个大型国际样本的常见的床和蝙蝠虫 (Cimex pipistrelle) 中的病毒社区.
• 为了识别和描述这些昆虫种群所携带的病毒.

主要方法:

• 在500多个现场采集的床和蝙蝠虫上进行了RNA测序,这些床和蝙蝠虫来自世界各地.
• 采用多个生物信息工作流来组装病毒结合物.
• 与参考核酸数据库对组装的结合物进行了查询,以确定病毒基因组.

主要成果:

• 在美国和欧洲的床和蝙蝠虫中检测到Shuangao床病毒2 (一种rhabdovirus),这表明它的流行程度.
• 书病虫病毒1在中国病虫样本中被发现,并且Enterobacteria菌体P7序列无处不在.
• 在采样的床中,总体病毒多样性很低,没有其他病毒基因组被检测到具有显著覆盖率.

结论:

• 研究结果表明,常见的病毒感染在常见的床虫和蝙蝠虫中并不常见.
• 该研究确定了Shuangao床病毒2作为这些人群中常见的病毒.
• 局限性包括对工业化国家的城市地区的关注,在其他环境中可能缺少感染.