DC-SIGN与登革热和寨卡病毒的包膜蛋白之间的相互作用:基于分子动力学和MM/GBSA分析的结构视角
Bruno Stein Barbosa Menechino1, Rodrigo Bentes Kato2, Helena Cristina Ferreira Franz2
1Multidisciplinary Center for Biological Research - Laboratory for the Development of Biological Models, University of Campinas, 5 de Junho St., 230, Cidade Universitária, Campinas, SP, 13083-877, Brazil.
Virology journal
|December 4, 2023
概括
寨卡病毒 (ZIKV) 与登革热病毒 (DENV) 相比,对DC-SIGN受体的结合更强. 这表明,ZIKV可能会在树突细胞上的这一关键相互作用中超过DENV,影响病毒复制.
科学领域:
- 病毒学 病毒学
- 免疫学 免疫学 免疫学
- 结构生物学 结构生物学
背景情况:
- 寨卡病毒 (ZIKV) 和登革热病毒 (DENV) 是密切相关的弗拉维病毒.
- 这两种病毒都有类似的传播途径和受体结合.
研究的目的:
- 为了研究ZIKV和DENV包膜蛋白与DC-SIGN之间的相互作用.
- 确定ZIKV和DENV在DC-SIGN绑定方面的竞争潜力.
主要方法:
- 蛋白质与蛋白质对接的模拟.
- 分子动力学实验.分子动力学实验.
- 一般化出生表面积 (GBSA) 的计算.
- 溶剂可访问表面积 (SASA) 分析.
主要成果:
- 与DENV相比,ZIKV包膜蛋白的结合能量较低,与DC-SIGN的相互作用更多.
- 特定的残留物 (PHE313,GLU241,ARG386) 被确定为关键的相互作用点.
- ZIKV显示了溶剂可访问的表面积略微减少,表明结合更紧.
结论:
- ZIKV与DC-SIGN受体的碳水化合物识别域 (CRD) 具有更有利的竞争相互作用.
- 这些发现表明,ZIKV在通过DC-SIGN启动感染方面可能比DENV具有竞争优势.
