在环境挑战和机会主义之间,Scedosporium的基因组

科学领域:

• * 菌类学和基因组学
• * 进化生物学 进化生物学
• * 医学真菌学 医学真菌学

背景情况:

• *新兴的真菌病原体构成全球健康威胁,但了解它们的机会主义和抗真菌耐药性落后于细菌病原体.
• *以环境耐受性而闻名的Scedosporium属包括重要的人类病原体,如S. apiospermum和S. boydii,但它们的基因组进化仍然不太清楚.
• *有限的知识阻碍了新出现的真菌病原体的识别,控制和解释.

研究的目的:

• * 测序和比较新的Scedosporium基因组 (S. aurantiacum,S. minutisporum) 与现有的Microascaceae和相关的真菌基因组.
• * 为了确定共享的基因组特征,与线状虫的致病潜力相关.
• * 研究特定基因家族在环境适应和人类宿主殖民中的作用,以及它们对抗真菌压力的反应.

主要方法:

• *对Scedosporium aurantiacum和Scedosporium minutisporum的全基因组测序进行了测序.
• * 在Scedosporium,Microascaceae和其他100种真菌基因组中进行比较基因组学.
• * 系统的注释和菌基因组的特征.
• *RNA测序 (RNA-seq) 用于分析抗真菌应激 (沃里可纳) 下的基因表达.

主要成果:

• *比较基因组学揭示了各种真菌病原性特征的有限进化趋同.
• * 在Microascaceae/Scedosporium中确定了特定的基因家族 (细胞壁组件,蛋白酶,载体),可能涉及环境适应和人类殖民.
• *这些基因家族显示出扩张,转子体插入和突变的证据,它们的表达对S. aurantiacum和S. minutisporum的伏利康纳应激反应.

结论:

• *基因组和转录组数据表明,Scedosporium中能够抵抗环境压力的特征可能预先适应它们对人类的感染.
• * 病原性和抗真菌耐药性是多因素的,受到古老的基因组特征和环境压力的影响.
• *这项研究促进了对机会性真菌病原体,它们的适应性以及基因组方法在这个领域的局限性的理解.