通过综合生物信息学分析与生物实验相结合,识别与血管认知障碍发展相关的候选基因
Yajing Cheng1,2, Ying Liu1, Rong Wu1
1Department of Neurology, General Hospital, Tianjin Medical University, Tianjin, China.
概括
血管认知障碍 (VCI) 研究确定了关键基因C1QA,C1QB,C1QC,CD163和FCGR2A. 这些基因在VCI大鼠海马体中高度表达,可以作为VCI的诊断和预后生物标志物.
科学领域:
- 神经科学是一个神经科学.
- 生物信息学是一种生物信息学.
- 遗传学 遗传学 是一个
背景情况:
- 血管认知障碍 (VCI) 对医疗保健系统构成越来越大的挑战,原因是病发率和死亡率的增加.
- 了解VCI的潜在分子机制对于开发有效治疗方法至关重要.
研究的目的:
- 通过生物信息学和实验验证,识别参与VCI病变的关键基因.
- 提供对VCI的机制和潜在治疗点的新见解.
主要方法:
- 从基因表达大巴中下载并分析VCI患者的基因表达数据 (GSE122063).
- 进行了权重基因共同表达网络分析,并构建了一个蛋白质-蛋白质相互作用网络.
- 在VCI大鼠模型中使用qPCR,西斑,免疫组织化学和免疫光检测验证了候选基因表达.
主要成果:
- 从共同表达网络分析中识别了44个枢纽基因和从PPI网络分析中识别了36个枢纽基因.
- 功能性丰富分析将已识别的基因与炎症途径联系起来,包括黄金葡萄球菌感染,补充和凝血级联.
- 发现C1QA,C1QB,C1QC,CD163和FCGR2A在VCI大鼠的海马中高度表达.
结论:
- 建议C1QA,C1QB,C1QC,CD163和FCGR2A作为VCI诊断和预后的候选生物标志物.
- 这些发现表明VCI的潜在分子机制,并突出了预防和治疗策略的新途径.
- 分子对接表明了五个已识别的基因和双A之间的相互作用,这表明VCI的潜在环境因素.


