在LC-MS非向代谢学当前实践:关于使用聚合质量控制样本的范围审查
Corey D Broeckling1, Richard D Beger2, Leo L Cheng3
1Analytical Resources Core: Bioanalysis and Omics Center; Department of Agricultural Biology, Colorado State University, Fort Collins, Colorado 80525, United States.
Analytical chemistry
|December 6, 2023
概括
聚合质量控制 (QC) 样本被广泛用于分析差异监测的非目标代谢学研究. 然而,它们用于提高数据质量和清晰报告的应用需要在整个领域进行重大改进.
科学领域:
- 代谢学 代谢学 代谢学
- 分析化学 分析化学
- 生物化学 生物化学
背景情况:
- 非向的代谢学对代谢表型形成至关重要.
- 在代谢学中的数据质量评估具有挑战性.
- 聚合质量控制 (QC) 样本有助于监测分析差异.
研究的目的:
- 审查在非向液体染色学-质谱学 (LC-MS) 代谢学研究中使用聚合QC样本的情况.
- 为了确定目前的实践,优势和缺陷,在集成QC样本的利用.
- 突出改善数据质量报告和方法的机会.
主要方法:
- 对已发表的非向性LC-MS代谢学研究进行了范围广泛的文献综述.
- 文献查询,过和随机抽样的文章.
- 109篇论文的审查由至少五名审查员使用预定义的问题进行.
主要成果:
- 聚合的QC样本在不同的生物种群和研究尺度中被广泛采用.
- 很少有研究报告使用聚合的质量控制样本来积极提高数据质量.
- 报告QC样本生成和使用方法往往含糊不清或不完整.
结论:
- 有一个重要的机会,更好地利用聚合的质量控制样本,以确保在代谢学中的数据质量.
- 需要对质量控制样本协议进行标准化和详细的报告.
- 集成QC样本的增强利用可以提高非目标LC-MS代谢学的可靠性.
