一种以不确定性为指导的深度学习方法促进了对CYP3A4抑制剂的快速选
Ruixuan Wang1, Zhikang Liu2, Jiahao Gong1
1Shanghai Frontiers Science Center of TCM Chemical Biology, Institute of Interdisciplinary Integrative Medicine Research, Shanghai University of Traditional Chinese Medicine, Shanghai 201203, China.
Journal of chemical information and modeling
|December 6, 2023
概括
这项研究引入了一种不确定性引导的回归模型,以预测与细胞染色体P450 3A4 (CYP3A4) 的药物相互作用. 这种新的方法提高了预测的准确性和可靠性,提高了药物发现效率.
科学领域:
- 药理学和药物新陈代谢
- 计算化学计算化学
- 药用化学 医学化学
背景情况:
- 细胞染色体P450 3A4 (CYP3A4) 对于超过一半临床药物的代谢至关重要.
- 评估CYP3A4抑制对于预防药物相互作用 (DDI) 和药物不良反应 (ADR) 至关重要.
- 现有的CYP抑制剂预测模型在预测抑制强度 (IC50) 和可靠性方面缺乏准确性.
研究的目的:
- 开发一种不确定性引导的回归模型,以准确地预测抗CYP3A4活动的IC50.
- 为了提高CYP抑制剂查的可靠性和精度.
- 提高药物发现和开发过程的效率.
主要方法:
- 编制了 27,045 个CYP3A4 抑制剂的综合数据集,其中包括 4,395 个IC50 值.
- 来自分类模型的综合预测与证据不确定性方法来排名信心.
- 应用证据不确定性值用于内部化合物集的虚拟选.
主要成果:
- 为IC50预测实现了高精度和可靠的回归模型.
- 证据不确定性显著改善了命中率,并减少了虚拟查中的错误阳性.
- 在排名前20名的化合物中,15种是新型CYP3A4抑制剂,其中3种显示活性<1μM.
结论:
- 将不确定性纳入复合选是一个有效的策略.
- 开发的模型提供了一种有前途的方法来识别强大的CYP3A4抑制剂.
- 这种方法可以通过提高抑制剂识别的准确性来加速药物发现和开发.
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