机器学习预测用于构建Panax桑素 (ginsenosides) 的通用多维信息库
Hongda Wang1, Lin Zhang1, Xiaohang Li1
1National Key Laboratory of Chinese Medicine Modernization, State Key Laboratory of Component-based Chinese Medicine, Tianjin University of Traditional Chinese Medicine, 10 Poyanghu Road, Tianjin 301617, China; Haihe Laboratory of Modern Chinese Medicine, Tianjin University of Traditional Chinese Medicine, 10 Poyanghu Road, Tianjin 301617, China.
现在可以准确识别包括异构体在内的Panax草本人参化物. 一个新的库,GinMIL,使用机器学习来预测保留时间和碰撞截面,提高了88%的识别精度.
科学领域:
- 分析化学 分析化学
- 自然产品化学 自然产品化学
- 药理学是指药理学,即药理学是指药理学.
背景情况:
- 鉴定Panax草本人参酸的特征是困难的,因为同位素和有限的参考标准.
- 结构信息对于精确识别和区分人参酸和它们的异构体至关重要.
研究的目的:
- 开发一个全面的多维 ginsenosides 信息库.
- 为了提高各种人参产品中人参化物识别的准确性.
主要方法:
- 使用了一个Vion离子移动高分辨率LC-MS平台.
- 通过使用机器学习 (渐变增强机器) 预测保留时间 (tR) 和碰撞截面 (CCS),建立了金氏多维信息库 (GinMIL).
- 验证了tR和CCS对数据库构建的稳定性和适用性.
主要成果:
- 金米尔 (GinMIL) 包含579种已知人参酸的多维信息 (m/z,分子公式,tR,CCS,MS/MS片段).
- 独特的LC-MS方法与GinMIL搜索相结合,显著提高了识别准确性.
- 开发的图书馆提高了约88%的异构体识别的准确性.
结论:
- GinMIL代表了一种基于层次设计的通用Panax沙胺库.
- 这种方法大大提高了人参化物表征的准确性,特别是对于具有挑战性的同位素识别.
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