使用IAM-HPLC和QSRR方法对小分子与脂的亲和力建模,并使用基于相似性的机器算法进行增强
1Department of Physical Chemistry, Faculty of Pharmacy, Medical University of Gdańsk, Al. Gen. J. Hallera 107, Gdańsk 80-416, Poland; QSAR Lab Ltd., Trzy Lipy 3St., Gdańsk 80-172, Poland.
Journal of chromatography. A
|December 6, 2023
概括
固定化人造膜色谱 (IAM) 提供了一种生物相似的方法来测量药物脂性. 这项研究开发了一种定量结构-保留关系模型,以预测小分子与脂的结合,帮助药物发现.
科学领域:
- 药理动力学和药物新陈代谢
- 计算化学计算化学
- 染色体学 染色体学 是一种染色学.
背景情况:
- 固定化人造膜色谱 (IAM) 是一种生物相似的替代传统的脂友性测量方法.
- 了解小分子-脂相互作用有助于预测体内行为,并加速药物发现.
- 预测人体内的异生态行为对于有效的药物开发至关重要.
研究的目的:
- 开发一种可解释的定量结构-保留关系 (QSRR) 模型,用于预测小分子对脂的亲和力.
- 将机械描述符与QSRR方法集成在一起,以提高预测能力.
- 根据经合组织指导方针验证模型并定义其适用范围.
主要方法:
- 量化结构与保留关系 (QSRR) 方法.
- 使用 Chemicalize 软件计算机械描述符.
- 处理异质数据的局部加权最小平方核回归.
- 基于经合组织建议和基于概率的基于距离的方法的验证适用性领域的定义.
主要成果:
- 该QSRR模型确定了脂性,电荷和最大投射面积作为脂结合的关键决定因素.
- 该模型表现出良好的预测能力,Q2为0.812和RMSEP为6.739.
- 一个很低的分子百分比 (1.5%的培训,2.8%的验证) 落在定义的适用性领域之外.
结论:
- 开发的QSRR模型有效地预测了小分子与脂的结合,支持药物发现工作.
- 该模型依赖脂友性,电荷和分子大小,为外来生物-脂相互作用提供了机械的洞察力.
- 强大的验证和定义的应用领域确保了该模型对新化学实体的可靠性和预测能力.
