尿样中短链的非向分析 短链的分析 短链的分析
SaraElsa Aita1, Andrea Cerrato1, Aldo Laganà1
1Dipartimento di Chimica, Università di Roma La Sapienza, Rome, Italy.
Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
|December 7, 2023
概括
这项研究引入了一种改进的方法来检测复杂样品中的短链,克服了诸如低丰度和离子抑制等挑战. 新的工作流通过实现全面的体表征来增强生物标志物发现.
科学领域:
- 分析化学 分析化学
- 生物化学 生物化学
- 蛋白质组学是指蛋白质组学.
背景情况:
- 短链对于生物标志物发现至关重要,但由于复杂矩阵中丰度低和离子抑制低,分析具有挑战性.
- 现有的类组学策略往往无法识别这些,需要专门的分析工作流.
研究的目的:
- 开发和验证一种用于隔离和清理短链的丰富策略.
- 建立一个全面的分析工作流程,用于尿样中的短链的表征.
主要方法:
- 石墨化碳黑固相提取用于丰富.
- 为了分离,采用了直角超高性能液态染色学 (UHPLC) 方法,包括逆相 (RP) 和水友相互作用液态染色学 (HILIC).
- 通过半自动化工作流程,使用高分辨率质谱与数据依赖采集和嫌疑人查来检测和识别.
主要成果:
- 联合RP和HILIC分离策略共识了212种独特的,其中101种来自RP和111种来自HILIC,以及60种共同的标识.
- 缩策略有效地解决了低丰度和离子抑制的挑战,使覆盖率更好.
结论:
- 开发的丰富和直角UHPLC-MS/MS策略显著改善了短链的全面表征.
- 这种工作流有望促进生物标志物发现和理解涉及短链的生物过程.
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