在精确和可预测的CRISPR/Cas9介导的染色体重组中,DNA聚合酶
Mohammadreza M Mehryar1,2, Xin Shi1,2, Jingwei Li1,2
1Center for Comparative Biomedicine, Ministry of Education Key Laboratory of Systems Biomedicine, State Key Laboratory of Systems Medicine for Cancer, School of Life Sciences and Biotechnology, Institute of Systems Biomedicine, Shanghai Jiao Tong University, Shanghai, 200240, China.
克里斯普尔基因编辑精确,但机制尚不清楚. 新的工具揭示了DNA修复中的大型删除和聚合酶作用 (Polθ,Polλ),改善了可控制的基因编辑结果.
科学领域:
- 分子生物学分子生物学
- 遗传学 是一个遗传学.
- 生物技术是生物技术.
背景情况:
- 克里斯普尔-Cas9基因编辑在重排结点提供了精确的结果.
- 在Cas9中介编辑的潜在机制仍然不太清楚.
- 缺乏合适的测定系统和分析工具阻碍了研究.
研究的目的:
- 开发用于分析CRISPR-Cas9编辑结果的新型测试系统和计算工具.
- 阐明在Cas9裂变后调节DNA修复的分子机制.
- 研究特定DNA聚合酶在基因编辑结果中的作用.
主要方法:
- 开发了一个定制的计算机程序来分析结节序列的读数.
- 使用HPRT1和DCK基因建立了一个敏感的记者测试系统.
- 利用了PolQ (Polθ) 的淘汰,并分析了对Polθ和Polλ的依赖.
主要成果:
- 在染色体重新排列结点发现了突出的大切除和删除.
- 证明了Polθ和Polλ在产生小 (1bp) 和大 (>1bp) 删除中的不同作用.
- 发现 Polλ 是主要的聚合酶,负责填充 Cas9 分裂中的 5' 悬架.
结论:
- 对CRISPR/Cas9DNA片段编辑中的分子机制的高级理解.
- 突出了Polθ和Polλ在DNA修复路径选择中的关键作用.
- 为开发更可控,更精确,更可预测的基因编辑策略提供了见解.
更多相关视频
11:35Selection-dependent and Independent Generation of CRISPR/Cas9-mediated Gene Knockouts in Mammalian Cells
Published on: June 16, 2017
10:07A Standard Methodology to Examine On-site Mutagenicity As a Function of Point Mutation Repair Catalyzed by CRISPR/Cas9 and SsODN in Human Cells
Published on: August 25, 2017
相关概念视频
CRISPR
Homologous Recombination
CRISPR and crRNAs
The CRISPR-Cas system stores a copy of foreign DNA in the host genome and uses it to identify the foreign DNA upon reinfection. CRISPR-Cas has three different...
Conservative Site-specific Recombination and Phase Variation
The recognition sites for Cre recombinase called LoxP...
Proofreading
Errors During Replication are Corrected by the DNA Polymerase...
Translesion DNA Polymerases
TLS polymerases are found in all three domains of life - archaea, bacteria, and eukaryotes. Of the different classes of TLS polymerases, members of the Y family are fitted with specialized structures that...
