综合性转录组分析揭示了与HPV相关的和与HPV无关的桃状状细胞癌中瘤微环境的独特基因表达模式
Reham M Alahmadi1, Najat Marraiki1, Mohammed Alswayyed2
1Department of Botany and Microbiology, College of Science, King Saud University, P.O. Box 22452, Riyadh 11495, Saudi Arabia.
Cancers
|December 9, 2023
概括
这项研究揭示了桃体状细胞癌 (TSCC) 的瘤微环境 (TME) 中明显的基因表达差异,区分了人类乳头瘤病毒 (HPV) 阳性和HPV阴性病例. 了解这些TME转录组是开发向癌症治疗的关键.
科学领域:
- 在瘤学瘤学.
- 免疫学 免疫学 免疫学
- 基因组学就是基因组学.
背景情况:
- 头部和部状细胞癌 (HNSCCs),特别是桃体状细胞癌 (TSCC),在全球面临重大健康挑战,死亡率高.
- 瘤微环境 (TME) 对HNSCC的进展和对治疗的反应至关重要,涉及炎症,免疫和遗传因素之间的复杂相互作用.
- 根据人类乳头瘤病毒 (HPV) 状态区分TME对于理解疾病异质性和开发有效治疗方法至关重要.
研究的目的:
- 在HPV阳性和HPV阴性TSCC中全面分析TME的转录组.
- 在TSCC TME中识别涉及炎症,免疫交叉,瘤发生和亡的差异表达基因.
- 阐明与HPV相关的与HPV无关的TSCC中TME的独特分子特征.
主要方法:
- 168个与细胞介质,炎症,免疫,瘤发生和亡相关的基因的基因表达概况.
- 不同基因表达分析比较HPV阳性和HPV阴性TSCC患者队列.
- 在TSCC患者样本中检测和基因定型高风险HPV (Hr-HPV).
主要成果:
- 确定了40个与TME中的瘤细胞和媒介通信相关的差异表达基因.
- 在HPV阳性 (33个过度表达的基因,26个独一无二的) 和HPV阴性 (11个上调基因) 之间观察到基因表达的显著差异.TSCC.
- 发现与瘤发生,瘤抑制,血管生成和亡相关的48个基因转录在两组中都被上调调,每个HPV状态组中都有不同的过度表达基因数量.
- 在81%的TSCC患者中检测到6种Hr-HPV基因型,其中HPV-16和HPV-35是最常见的.
结论:
- 与HPV相关的和与HPV无关的TSCC的TME表现出明显的转录组异质性.
- 参与细胞媒介,炎症,免疫和瘤发生的基因的失调是TSCC TME的特征.
- 需要进一步的功能和分子研究来探索针对TSCC中已识别的基因的治疗潜力.
