在胃癌中涉及的关键长非编码RNAs的表达:生物信息学和临床研究
Ramtin Mohammadi1, Ali Zareh2, Elmira Rabani1
1Department of Biology, Central Tehran Branch, Islamic Azad University, Tehran, Iran.
Biochemical genetics
|December 9, 2023
概括
这项研究确定了像HCG18,OIP5-AS1,FGD5-AS1和NORAD这样的关键长非编码RNA (lncRNAs) 作为胃癌 (GC) 发展的潜在驱动因素. 生物信息学和qRT-PCR证实了它们在GC组织中的高表达,这表明它们具有诊断价值.
科学领域:
- 在瘤学瘤学.
- 分子生物学分子生物学
- 生物信息学是一种生物信息学.
背景情况:
- 胃癌 (GC) 是全球癌症死亡的主要原因之一.
- 长非编码RNAs (lncRNAs) 在GC病变发生中的特定作用仍然不完全理解.
研究的目的:
- 用生物信息学来识别和优先考虑涉及GC开发的lncRNAs.
- 实验验证GC组织中排名最高的lncRNAs的表达和诊断潜力.
主要方法:
- 生物信息分析以基于其在GC中的潜在作用来对lncRNA进行排名.
- 定量实时聚合酶连锁反应 (qRT-PCR) 用于在35个GC和相邻的非瘤样本中进行表达验证.
- 接收器操作特征 (ROC) 曲线分析以评估诊断效率 (曲线下的面积 - AUC).
主要成果:
- 生物信息学发现HCG18是与GC相关的最高排名的lncRNA.
- 与非瘤组织相比,HCG18,OIP5-AS1,FGD5-AS1和NORAD在GC组织中表达显著增加.
- AUC值表明了诊断潜力:HCG18 (0.80),OIP5-AS1 (0.74),FGD5-AS1 (0.73) 和NORAD (0.71),这些值表明了诊断潜力:HCG18 (0.80),OIP5-AS1 (0.74),FGD5-AS1 (0.73) 和NORAD (0.71).
结论:
- lncRNAs HCG18,OIP5-AS1,FGD5-AS1和NORAD可能参与胃癌的发展.
- 生物信息学方法对于识别与GC进展相关的新 lncRNAs 是有效的.
- 这些lncRNAs可能作为胃癌的潜在诊断生物标志物.
