哈希莫托甲状腺炎患者的全血中全基因组DNA甲基化模式
Zheng Zhou1,2,3, Jinjin Liu1,2,3, Yun Chen1,2,3
1Disorders Control, Centre for Endemic Disease Control, Chinese Centre for Disease Control and Prevention, Harbin Medical University, Harbin, Heilongjiang, China.
Frontiers in endocrinology
|December 11, 2023
概括
在哈希莫托甲状腺炎 (HT) 中观察到DNA甲基化的表观遗传变化. SLFN12基因被确定为一种潜在的表观遗传生物标志物,用于区分HT患者与健康个体.
科学领域:
- 免疫学 免疫学 免疫学
- 遗传学 是一个遗传学.
- 表观遗传学 在表观遗传学中,表观遗传学是指表观遗传学.
背景情况:
- 哈西莫托甲状腺炎 (HT) 是一种常见的自身免疫性疾病,其发病因子尚未完全理解.
- 表观遗传修饰,特别是DNA甲基化在HT发展中的作用需要进一步研究.
研究的目的:
- 从HT患者的全血中全面描述全基因组DNA甲基化.
- 确定HT诊断的潜在表观遗传生物标志物,并了解疾病机制.
主要方法:
- 用Illumina 850K BeadChip对10对匹配的HT患者和健康对照进行全基因组DNA甲基化评估.
- 使用基因本体学和KEGG数据库识别和功能注释差异甲基化基因 (DMG).
- 通过定量逆转录PCR (qRT-PCR) 验证表观遗传生物标志物基因表达.
主要成果:
- 与对照组相比,在HT受试者中观察到总体低甲基化,确定了283个差异甲基化位置 (DMP).
- 在HT患者中,SLFN12基因在其促进子区域表现出显著的低甲基化,与增加的mRNA表达相关.
- SLFN12甲基化水平与TSH呈负相关性,与FT4呈正相关性,区分HT患者的AUC为0.85.
结论:
- 这项研究提供了HT的第一个全面的DNA甲基化概况,使患者和对照者之间能够进行表观遗传差异化.
- SLFN12基因与HT病原发生有关,并显示出作为HT的潜在表观遗传生物标志物具有前途.
