关于Enterococcus faeciumBT22的基因组测序数据草案,BT22是从医院废水中分离出来的抗万科米辛的机会性病原体
Taha Ahmed Benabbou1,2,3, Lotfi Ghellai1,2, Mokhtar Benreguieg1,2
1Department of Biology, Faculty of Sciences, University of Saida Dr Moulay Tahar, BP 138 ENNASR 20000, Saida, Algeria.
Data in brief
|December 11, 2023
概括
从医院的废水中分离出一种抗万科米辛的Enterococcus faecium菌株,BT22. 它的基因组揭示了抗生素耐药性和毒性基因,为对抗耐药细菌菌株提供了洞察力.
科学领域:
- 微生物学 微生物学
- 基因组学就是基因组学.
- 抗微生物耐药性 抗微生物耐药性
背景情况:
- 医院的废水是抗生素耐药细菌的储存库.
- 菌 (Enterococcus faecium) 是一个重要的机会性病原体.
- 肠球菌中的万科米辛耐药性构成了严重的公共卫生威胁.
研究的目的:
- 为了描述抗万科米的Enterococcus faecium菌株BT22.的特征.
- 为了执行BT22.22菌株的全基因组测序.
- 在基因组中识别抗生素耐药性和毒性基因.
主要方法:
- 从医院的废水中分离细菌.
- 使用Illumina MiSeq平台进行全基因组测序.
- 遗传学分析和基因鉴定.
主要成果:
- E. faecium BT22的完整基因组为2,577,707个基因组,其中有2462个CDS.
- 菌株BT22具有12个抗生素耐药性基因 (包括万科米) 和一个粘附性毒性基因.
- 检测到移动遗传元素,包括IS元素和一个结合性等离子体.
结论:
- 对E. faecium BT22的基因组数据提高了对抗生素耐药性机制的理解.
- 这种基因组资源有助于对抗抗万科米辛耐药性肠球菌的传播.
- 这些发现有助于监测和控制医院获得感染的战略.


