评估各种复合采样模式,以检测原生污水中的致病性SARS-CoV-2病毒

科学领域:

• 环境微生物学环境微生物学
• 公共卫生监督是对公共卫生的监督.
• 分子流行病学分子流行病学

背景情况:

• 不准确的废水采样可能会影响病毒度估计,影响公共卫生决策.
• 在废水中偶发的病毒输入需要强大的采样策略来进行可靠的监测.

研究的目的:

• 确定最佳的复合采样策略,用于在原始废水中代表性检测SARS-CoV-2.
• 评估废水复合采样的不同时间间隔和窗口.

主要方法:

• 在学生宿舍进行实地试验,使用间隔1小时至24小时的复合采样器和各种时间窗口.
• 使用反转录-定量聚合酶连锁反应对SARS-CoV-2和胡轻度斑点病毒 (PMMoV) RNA的量化.
• 统计分析 (四方非参数ANCOVA) 以确定影响样本代表性的重要因素.

主要成果:

• 与SARS-CoV-2 RNA相比,PMMoV RNA的丰度和变异性更高,作为便污染的可靠指标.
• 与较长的复合间隔相比,1小时复合样本对两种病毒的变异性更高.
• 一个6小时的早晨复合采样窗口被确定为捕获代表性SARS-CoV-2RNA水平的最佳时间.

结论:

• 聚焦6小时的早晨复合采样策略是SARS-CoV-2的废水流行病学的务实和成本效益的方法.
• 这种优化的抽样方法提高了社区一级公共卫生监测数据的准确性和可靠性.
• 改善废水监测可以在流行病期间导致更知情的公共卫生决策.