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Using Computer Vision Libraries to Streamline Nuclei Quantification
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HiTIPS:用于研究核架构和基因表达的高通量图像处理软件
bioRxiv : the preprint server for biology
|December 11, 2023
概括
高通量成像 (HTI) 分析得到了HiTIPS的增强,这是一个新的开源平台. 它提供可定制的工作流程,用于复杂的生物图像分析,改善细胞和细胞核细分和跟踪.
科学领域:
- 细胞生物学 细胞生物学
- 生物成像是一种生物成像.
- 计算生物学是一种计算生物学.
背景情况:
- 高通量成像 (HTI) 产生了庞大的数据集,但当前的软件限制了新算法的定制和集成.
- 现有的开源平台提供模块,但难以无整合新的分析技术.
结论:
- HiTIPS为各种细胞生物学应用提供了一个用户友好,灵活和可扩展的平台.
- 允许定制分析工作流程用于高通量DNA FISH,免疫光和活细胞成像.
- 促进在HTI分析管道中采用新型算法.
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