克洛斯特里新生儿抗菌敏感性,遗传耐药性决定因素和基因定型:一个多中心的时空空间回顾性分析

科学领域:

• 微生物学 微生物学
• 遗传学 是一个遗传学.
• 传染性疾病 传染性疾病

背景情况:

• 2002年在新生儿死性肠球炎 (NEC) 爆发期间发现的新生儿死菌 (Clostridium neonatale) 在2018年被验证为一个不同的物种.
• 这项研究研究了新生儿C. neonatale的临床分离物,以了解它们的抗微生物耐药性和遗传构成.

研究的目的:

• 评估C.新生儿临床分离物的抗菌敏感性.
• 确定负责C.新生儿抗菌耐药性的遗传决定因素.
• 分析C.新生儿分离物之间的遗传关系.

主要方法:

• 从早产新生儿的便中分离出68种C.新生儿菌株.
• 针对克林达米辛,塞福胺和四环素进行了抗菌感应性测试 (盘扩散和MIC确定).
• 用PCR和全基因组测序 (WGS) 选遗传耐药性决定因素,并通过多部位序列类型 (MLST) 进行基因型定型.

主要成果:

• 在35%的分离物中观察到对克林达米辛的抗药性,10%对塞福他辛的抗药性,1%对四环素的抗药性.
• 确定了特定的耐药基因,包括erm{B},tet{M},tet{O}和tet{32},其中一些与特定的序列类型 (ST) 相关.
• 世界基因组发现了更多的抗性基因,如 aph(3') -IIa,blaTEM-116,以及一个类似 blaCBP-1 的基因,通常靠近移动遗传元素.

结论:

• 新生儿C. neonatale对标准的抗厌氧剂表现出敏感性,但对克林达米辛,塞福和四环素表现出耐药性.
• 已识别的抗性基因 (四环素核糖体保护,类耐药性,氨基甘油酸转化酶,β-乳糖酶) 位于移动遗传元素中.
• 这些发现表明,在C.新生儿种群中,抗菌素耐药性可能会扩散.