在β-aminopropionitrile诱导的大动脉剖析小鼠模型和人类大动脉剖析之间的转录组的比较生物信息学分析
1Department of Vascular Surgery, Union Hospital, Tongji Medical College, Huazhong University of Science and Technology, Wuhan, China.
Journal of thoracic disease
|December 13, 2023
概括
这项研究比较了小鼠和人类大动脉剖析 (AD) 转录组,识别了共享的基因和途径. 它强调了AD的潜在诊断标记和治疗目标.
科学领域:
- 心血管研究研究心血管研究
- 基因组学就是基因组学.
- 生物信息学是一种生物信息学.
背景情况:
- 大动脉解剖 (AD) 缺乏明显的致病机制.
- 像β-aminopropionitrile (BAPN) 诱导的AD这样的小鼠模型对于研究至关重要.
- 了解阿尔茨海默病的发病因子对于开发新疗法至关重要.
研究的目的:
- 为了确定AD诊断和治疗的分子标记物和途径.
- 为了比较小鼠AD模型和人类AD的转录组.
- 为AD研究利用生物信息学.
主要方法:
- 构建了一个BAPN诱导的小鼠AD模型.
- 分析了来自小鼠模型和人类AD (GSE147026) 的高通量测序数据.
- 利用生物信息学工具 (R,DESeq,STRING) 进行差异基因表达,途径丰富和网络分析.
主要成果:
- 鉴定了463个不同表达的基因,这些基因在小鼠和人类AD转录组中都很常见.
- 在细胞因子-细胞因子受体相互作用,结核病和细胞体通路中发现了显著的丰富.
- 突出了CDC20,CCNB2和CCNB1作为AD发展中的潜在关键基因.
结论:
- 这项研究提供了第一个转录性比较,在小鼠BAPN诱导的AD模型和人类AD.
- 确定了重叠的差异表达基因,关键通路和潜在的治疗药物.
- 为发现AD的新型诊断和治疗分子标记提供了基础.
