微生物群通过微生物群-基因组相关联网络调节肺状细胞癌淋巴结转移
Peng Liang1, Hongsheng Deng1, Yi Zhao1
1Department of Thoracic Surgery and Oncology, the First Affiliated Hospital of Guangzhou Medical University, Guangzhou Institute of Respiratory Health, State Key Laboratory of Respiratory Disease, National Clinical Research Center for Respiratory Disease, Guangzhou, China.
Translational lung cancer research
|December 13, 2023
概括
像Proteus和Bacteroides这样的瘤微生物可能会在肺癌中驱动淋巴结转移. 了解这些微生物联系可能会导致管理癌症传播的新策略.
科学领域:
- 在瘤学瘤学.
- 微生物组研究 微生物组研究
- 基因组学就是基因组学.
背景情况:
- 肺状细胞癌 (LUSC) 中的瘤居住微生物群与癌症的发病和进展有关.
- 肠道微生物群影响免疫疗法的疗效,但其在淋巴结 (LN) 转移中的作用尚不清楚.
- 研究瘤微生物群在LN转移中的作用对于临床决策和预后至关重要.
研究的目的:
- 探索瘤寄存微生物群在促进肺状细胞癌 (LUSC) 淋巴结 (LN) 转移中的潜在作用.
- 通过分析微生物群-基因组相互作用来描述LN转移的分子病变发生.
主要方法:
- 利用了来自癌症基因组图谱 (TCGA) 的RNA测序和临床数据.
- 从cBioPortal数据库访问了微生物量化数据.
- 进行突变特征分析,转录组分析,基因组丰富分析,免疫透和微生物群-基因组网络分析.
主要成果:
- 在患有和没有LN转移的患者中确定了不同的瘤微生物群组成和微生物生物标志物.
- 在LN转移的患者中发现升调的基因组 (例如,Myc目标,E2F目标,DNA修复).
- 在LN转移患者中发现了Proteus和Bacteroides与与瘤发育和能量代谢相关的基因组之间的强烈相关性.
结论:
- 已经确立了内微生物群和宿主基因表达特征之间的关联.
- 在LN转移的背景下突出了Proteus和Bacteroides的相关性网络.
- 建议这些微生物相关性可能为调节淋巴结转移提供新的策略.
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