一个高效和通用的In silico选策略,用于获取高亲和度的Aptamer及其在分析实用工具中的应用
Qionglin Wang1, Pengbo Guo1, Weyland Cheng1
1Henan Key Laboratory of Children's Genetics and Metabolic Diseases, Children's Hospital Affiliated to Zhengzhou University, Zhengzhou, Henan, 450018, China.
Talanta
|December 13, 2023
概括
一种新的in silico选策略 (ISS) 提高了对神经元特异性酶 (NSE) 等标的aptamer亲和力. 这种方法增强了阿帕特默的分析效用,从而使生物标志物的检测更加敏感.
科学领域:
- 生物技术是生物技术.
- 分子生物学分子生物学
- 生物化学 生物化学
背景情况:
- 通过指数式丰富 (SELEX) 技术对联体的系统演化识别了aptamer,但往往产生不够的亲和力.
- 在SELEX的局限性需要改进的方法来发现高亲和度的aptamers.
研究的目的:
- 开发一种合理的in silico选策略 (ISS) 以有效地识别高亲和度的体.
- 为了评估ISS在选择具有更好的结合和分析性能的aptamers中的有效性.
主要方法:
- 开发了一种包含形状互补性和热力学稳定性的ISS,用于aptamer选.
- 选择神经元特异性酶 (NSE) 作为目标分子.
- 使用解离常数 (Kd) 验证了胺候选物,并开发了一种光胺传感器.
主要成果:
- 确定了三种候选的aptamer与NSE相比,与母aptamer相比,对NSE的亲和力显著更高.
- 最高亲和度的阿巴 (P-5C8G) 显示Kd为2.76nM.
- 使用P-5C8G的无抗体光吸收传感器实现了1.8nm的低检测极限 (LOD).
结论:
- 拟议的ISS是一个高效和通用的战略,用于增强aptamer亲和力和分析效用.
- 国际空间站提供了一个合理的方法来克服SELEX在aptamer开发中的局限性.
- 开发的食感器传感器对敏感生物标志物检测有希望.
