对Saposhnikovia divaricata的转录组分析和螺栓和开花基因的挖掘

科学领域:

• 植物分子生物学 植物分子生物学
• 基因组学就是基因组学.
• 药用植物学 医学植物学

背景情况:

• 在Saposhnikovia divaricata中早期封锁会对其药用价值和资源可持续性产生负面影响.
• 在S. divaricata的螺栓和开花背后的分子机制在很大程度上仍然没有特征.

研究的目的:

• 调查S. divaricata的转录组,以确定与螺栓和开花相关的基因和途径.
• 阐明S. divaricata早期螺栓化的分子基础,以告知育种和栽培策略.

主要方法:

• 高通量转录基因组测序S. divaricata在芽和开花阶段的叶子.
• 生物信息分析包括组装,注释,差异基因表达分析 (GO,KEGG) 和转录因子识别.
• 使用实时光定量PCR (qRT-PCR) 验证了七个候选基因.

主要成果:

• 产生了超过2.49亿次清洁读数,组装了67,866个单基因.
• 确定了993个差异表达的基因,其中21个候选基因与螺栓和开花有关.
• 证实了植物激素信号转导通路的显著丰富,特别是与auxin相关的基因 (IAA和TIR1).
• 发现NAC,MYB_related,HB-other,ARF和AP2家族是调节开花的关键转录因子群.

结论:

• 植物激素信号转导通路,特别是通过IAA和TIR1基因传递auxin信号,在控制S. divaricata的螺栓和开花方面发挥着关键作用.
• 了解这些遗传因素对于提高S. divaricata资源的药用价值和可持续发展至关重要.