快速检测H5亚型禽流感病毒使用CRISPR Cas13a基于侧流量计杆的快速检测
Yang Li1, Jiajing Shang1,2, Juan Luo1,2
1China Animal Health and Epidemiology Center, Qingdao, China.
Frontiers in microbiology
|December 14, 2023
概括
开发了一种新的高致病性禽流感 (HPAI) H5亚型病毒 (H5-AIV) 快速诊断测试. 这种高效的检测方法提供了与RT-qPCR可比的准确H5-AIV检测,适合现场使用.
科学领域:
- 兽医病毒学 兽医病毒学
- 分子诊断学 分子诊断学
- 一个健康,一个健康.
背景情况:
- 高致病性禽流感 (HPAI) 对家禽业和公共卫生构成重大经济威胁.
- 禽流感病毒的H5亚型 (H5-AIV) 由于其广泛的影响,是一个主要问题.
- 目前的检测方法,如病毒隔离和RT-qPCR是有效的,但耗时和劳动密集型.
研究的目的:
- 开发一种快速,方便和准确的诊断方法来检测H5-AIV.
- 为H5-AIV监测和隔离建立一个可在现场部署的测定方法.
主要方法:
- 开发一种复合酶辅助放大 (RAA) 与CRISPR-Cas13a和侧向流量滴棒 (LFD) 试验相结合的方法.
- 在37°C时对测量速度和灵敏度进行优化.
- 使用临床样本进行验证,并与RT-qPCR进行比较.
主要成果:
- 在RT-RAA-Cas13a-LFD测定检测到H5-AIV在40分钟内.
- 达到0.1拷贝/μL的检测极限,与RT-qPCR相比.
- 在临床样本中证明了高特异性,没有对其他禽类病毒的交叉反应,并且与RT-qPCR具有很高的一致性 (κ=0.89).
结论:
- 一种使用RAA,CRISPR-Cas13a和LFD检测H5-AIV的新,高效和准确的方法已成功建立.
- 通过LFD进行测试的视觉解释性使其适用于基层实验室和现场应用.
- 这种方法为临床H5-AIV诊断和家禽隔离提供了有前途的工具.
