开发和验证一个多重 TaqMan 探头 qPCR 试验的开发和验证,该试验特定于三种感染Meliosma myriantha的生真菌

科学领域:

• 植物病理学 植物病理学
• 分子诊断学 分子诊断
• 菌类学 菌类学是指菌类学.

背景情况:

• 腐蚀真菌是重要的有义务植物病原体,对全球农业和森林造成重大损害.
• 三种特定的生物种,Neophysopella meliosmae,N. meliosmae-myrianthae和N. vitis感染了东亚的树Meliosma myriantha.
• 根据早期症状区分这些生物种是很困难的,这会使诊断和管理变得复杂,特别是因为一些物种也会感染葡萄树和藤枝.

研究的目的:

• 开发一种快速而准确的诊断方法,以区分三种Neophysopella生物种.
• 创建一种能够在各种宿主植物中检测这些病原体的工具,包括Meliosma myriantha,葡萄树和伊维斯.
• 为了促进早期检测和监测生病原体的传播.

主要方法:

• 开发一个多重定量聚合酶连锁反应 (qPCR) 试验.
• 利用TaqMan探针针对三个生病原体的特定内部转录间隔器 (ITS) rDNA序列.
• 用新鲜和草本植物受感染植物样本的DNA验证试验.

主要成果:

• 多重qPCR试验成功检测了所有三个Neophysopella物种的微小数量的DNA (N. meliosmae-myrianthae的低至5 fg,N. meliosmae和N. vitis的低至50 fg).
• 该试验在不同的样品类型中显示出一致的可靠性,包括新鲜和草本标本.
• 这种方法在识别 *M. myriantha*,葡萄树 (*Vitis* spp. *) 中的致病原体目标中被证明是有效的. ),以及伊维斯 (*Parthenocissus* spp. 种类) 的植物. ) 的情况.

结论:

• 一种新的,快速和强大的多重qPCR测定方法已经建立起来,用于准确识别*N. meliosmae*,*N. meliosmae-myrianthae*和*N. vitis*.
• 这种诊断工具对于区分具有重叠宿主范围的密切相关的生物种至关重要.
• 该测试有潜力显著帮助追踪这些重要的植物病原体的全球移动和传播.