集成的多omics分析分析,以剖析转移性肝细胞癌的空间时间演变
Yunfan Sun1, Pin Wu2, Zefan Zhang1
1Department of Liver Surgery, Liver Cancer Institute, Zhongshan Hospital, Fudan University; Key Laboratory of Carcinogenesis and Cancer Invasion, Ministry of Education, Shanghai 200032, China.
Cancer cell
|December 15, 2023
概括
转移性肝细胞癌 (HCC) 的演变涉及基因组分歧和早期传播. 新抗原异质性和Wnt独立途径驱动转移,影响T细胞反应.
科学领域:
- 在瘤学瘤学.
- 基因组学就是基因组学.
- 癌症转移 癌症转移
背景情况:
- 对转移性肝细胞癌 (HCC) 的全面分子分析是有限的.
- 了解HCC转移的进化动态对于有效的治疗策略至关重要.
研究的目的:
- 进行原发性和转移性HCC的多原子分析,以阐明转移的机制.
- 研究基因组分歧,新抗原异质性以及特定突变和微环境在HCC进展中的作用.
主要方法:
- 多原子分析 (基因组学,转录组学等) 从182名HCK患者的257个原发性和176个转移性区域.
- 对基因组分歧,新抗原瘤内部异质性,副本数量变化和瘤微环境组成的分析.
- 研究Wnt突变,纤维细胞激活和免疫细胞透 (B细胞,CD8+T细胞).
主要成果:
- 初级和转移性HCC之间的高基因组分歧,流行早期传播.
- 转移中的新抗原异质性与由于呈现中断的T细胞反应性降低相关.
- 身体拷贝数的改变是转移的关键驱动因素;Wnt-wildtype亚克隆表现出更强大的转移优势.
- 野生型转移显示了免疫抑制性B细胞的增加,导致CD8+T细胞通过HLA-E:CD94-NKG2A轴耗尽.
结论:
- 转移性HCC通过显著的基因组变化和早期传播而演变.
- 新抗原的异质性和特定的微环境因素 (Wnt独立途径,激活的纤维细胞,免疫抑制的B细胞) 对转移至关重要.
- 新抗原呈现和免疫检查点的破坏有助于转移性HCC的治疗耐药性.
