基因参数的估计和单步全基因组关联研究,对荷尔斯坦乳牛的食时间和反时间
Hadi Atashi1, Pauline Lemal2, Marie-Nguyet Tran3
1TERRA Teaching and Research Center, Gembloux Agro-Bio Tech, University of Liège, 5030 Gembloux, Belgium; Department of Animal Science, Shiraz University, 71441-13131 Shiraz, Iran.
Journal of dairy science
|December 15, 2023
概括
这项研究确定了与Holstein奶牛的食用时间 (ET) 和反时间 (RUT) 相关的基因组区域,为养行为的遗传基础提供了洞察力. 需要对更大的数据集进行进一步的研究,以探索它们在育种计划中的使用.
科学领域:
- 动物遗传学动物遗传学
- 乳制品科学 乳制品科学
- 行为遗传学 行为遗传学
背景情况:
- 食时间 (ET) 和反时间 (RUT) 对奶牛的健康和生产力至关重要.
- 了解这些行为的遗传基础可以为繁殖策略提供信息.
- 之前的研究已经探索了遗传参数,但与ET和RUT相关的基因组区域需要进一步调查.
研究的目的:
- 估计霍尔斯坦乳牛中ET和RUT的遗传参数.
- 确定与ET和RUT相关的特定基因组区域.
- 估计ET,RUT和牛奶产量特征之间的遗传相关性.
主要方法:
- 利用了来自比利时6个群的284头荷尔斯坦牛 (2019-2022) 的数据.
- 采用随机回归测试日模型和贝叶斯基布斯采样来估计遗传参数.
- 应用单步基因组最佳线性无偏预测 (GBLUP) 方法,对28994个SNP进行全基因组关联分析.
主要成果:
- 对ET和RUT的遗传概率估计为中度 (0.42-0.45).
- 在ET和RUT (0.27-0.34) 之间观察到积极的遗传相关性.
- 在5个染色体 (BTA1,BTA4,BTA11,BTA14,BTA17) 上确定了与ET或RUT相关的6个显著的基因组区域.
结论:
- 这项研究提供了对乳牛养行为遗传结构的初步见解.
- 已确定的基因组区域为未来的基因改进提供了潜在的目标.
- 建议使用更大的数据集来验证发现,并评估ET和RUT在选择程序中的实用性.
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