在酵母菌Saccharomyces cerevisiae中剖析ubiquitylation和DNA损伤反应途径,使用全蛋白质组的方法
Ewa Blaszczak1, Emeline Pasquier2, Gaëlle Le Dez2
1Department of Genetics and Cell Physiology, Faculty of Biological Sciences, University of Wroclaw, Wroclaw, Poland; Department of Biochemistry and Molecular Biology, Faculty of Medical Sciences, Medical University of Lublin, Lublin, Poland.
Molecular & cellular proteomics : MCP
|December 15, 2023
概括
这项研究揭示了无处不在如何调节用甲基甲硫酸盐 (MMS) 治疗的酵母细胞中的DNA损伤反应 (DDR). 研究人员确定了许多无处不在的蛋白质,突出了在DNA修复中无处不在蛋白质-蛋白酶系统的作用.
科学领域:
- 分子生物学分子生物学
- 细胞生物学 细胞生物学
- 蛋白质组学是指蛋白质组学.
背景情况:
- DNA损伤反应 (DDR) 是一个复杂的细胞网络,对于保持基因组稳定性至关重要.
- 翻译后的修改,特别是无处不在,是DDR路径中的关键调节者.
研究的目的:
- 在暴露于DNA化剂甲基甲硫酸盐 (MMS) 时,全面描述Saccharomyces cerevisiae中的无处不在.
- 识别涉及DDR和DNA复制压力的新型无处不在的蛋白质和无处不在位点.
主要方法:
- 在细胞培养中使用氨基酸稳定同位素标记的定量蛋白质组学 (SILAC).
- 丰富无处不在的,然后进行液体染色学-并联质谱法 (LC-MS/MS).
- 核蛋白丰度变化和过度表达菌株对MMS的敏感度的测定.
主要成果:
- 鉴定了1853种无处不在的蛋白质,其中473种在MMS治疗后升高超过2倍.
- 在435个由MMS调节的蛋白质中定位了519个潜在的无处不在位点.
- 证明某些已识别的蛋白质的过度表达会导致MMS敏感性.
- 几个核蛋白在响应MMS治疗时的差异调节.
结论:
- 在DNA损伤反应中,ubiquitylation是一个关键的调节机制.
- 无素-蛋白酶体系统在管理DDR方面发挥着重要作用.
- 这项研究为了解DNA修复中的无处不在提供了有价值的蛋白质学资源.
