伊拉姆重塑了RssB细分螺旋链接器,以稳定s,防止ClpXP的降解
Christiane Brugger1, Srinivas Srirangam1, Alexandra M Deaconescu1
1Department of Molecular Biology, Cell Biology and Biochemistry, Brown University, Providence, Rhode Island, USA.
在肠道细菌的饥饿过程中,Iram蛋白质可以防止sigma S (σs) 的降解. 结构分析显示,Iram诱导RssB的结构变化,抑制应激反应基因的激活.
科学领域:
- 微生物学 微生物学
- 结构生物学 结构生物学
- 分子生物学分子生物学
背景情况:
- 肠道细菌通过S sigma (σs) 的ClpXP蛋白解来调节毒性和压力反应.
- IraM是一种抗适应蛋白,在Mg2+饥饿期间抑制s降解,这种情况与细菌毒性有关.
- IraM 抑制 σs 在 ClpXP 上依赖 RssB 的加载的机制尚不清楚.
研究的目的:
- 阐明Iram抑制RssB介导的s蛋白解的结构机制.
- 了解Iram如何调节肠道细菌的核心应激反应途径.
主要方法:
- 用X射线结晶学或Cryo-EM进行与Iram结合的RssB的结构分析.
- 生物化学试验证实抑制s的结合和加载到ClpXP.
主要成果:
- 结构分析显示,Iram在RssB中诱导了两个不同的折叠过渡,由细分螺旋链接器介导.
- 这些形状变化导致一个开放的RssB结构,其中Iram与C端和N端域结合.
- IraM 结合阻止了 σs 与 RssB 的 N-终端接收器域的结合,特别是 4-5-5 面.
结论:
- 通过诱导RssB.中的显著结构可塑性,Iram作为一种特异性应激对手.
- 这种抑制机制有效地阻断s降解,导致s的积累和抗压基因的激活.
- 了解这种途径为控制细菌毒性,生物膜形成和抗生素耐药性提供了潜在的目标.
更多相关视频
11:33Monitoring the Assembly of a Secreted Bacterial Virulence Factor Using Site-specific Crosslinking
Published on: December 17, 2013
09:37Combining Non-reducing SDS-PAGE Analysis and Chemical Crosslinking to Detect Multimeric Complexes Stabilized by Disulfide Linkages in Mammalian Cells in Culture
Published on: May 2, 2019
相关概念视频
Restarting Stalled Replication Forks
Translesion DNA Polymerases
TLS polymerases are found in all three domains of life - archaea, bacteria, and eukaryotes. Of the different classes of TLS polymerases, members of the Y family are fitted with specialized structures that...
Regulation of the Unfolded Protein Response
Single-Strand DNA Binding Proteins
Protein Modifications in the RER
Broadly, these modifications can be categorized into four main categories — glycosylation, formation of disulfide bonds, assembly of protein subunits, and specific proteolytic cleavages like removal of signal...
Export of Misfolded Proteins out of the ER
