Calceolariaceae809:一个诱,用于核基位的有针对性的测序

科学领域:

• 植物学 植物学
• 进化生物学 进化生物学
• 基因组学就是基因组学.

背景情况:

• 科 (Calceolariaceae) 是一个重要的安第斯植物群,具有近期,快速辐射和复杂的分类需求.
• 卡尔西奥拉里亚 (Calceolaria) 作为研究专门授粉系统的模型,特别是其无花蜜的花朵,为专业蜜蜂提供花油作为奖励.
• 尽管它们在生态和进化方面具有重要意义,但解决Calceolaria的分类学一直是具有挑战性的.

研究的目的:

• 开发一种新型的诱套件,用于针对性地测序Calceolaria和相关物种中的核位点.
• 为了解决获得超多样化的Calceolaria属的已解决的系谱的困难.

主要方法:

• 创建了一个生物信息工作流程,以从10种Calceolaria物种的低覆盖基因组中识别单拷贝位点.
• 针对性测序的诱是基于已识别的位置设计的,并在和体外验证.

主要成果:

• 确定了809个单复制的位点 (733个非编码,76个编码),导致了39937个诱的发展.
• 在 silico 和 in vitro 验证证明了诱集在恢复强大的家族遗传估计中的有效性.

结论:

• 开发的诱套件适合对最近和历史的Calceolaria标本进行测序.
• 这一进步有助于进一步研究多样化的Calceolaria属的进化历史.