将单个神经元的轴突重建转化为小鼠体感性丘脑中的中等尺度连接统计
Nestor Timonidis1, Rembrandt Bakker1,2, Mario Rubio-Teves3
1Neuroinformatics Department, Donders Centre for Neuroscience, Radboud University Nijmegen, Nijmegen, Netherlands.
Frontiers in neuroinformatics
|December 18, 2023
概括
这项研究揭示了腹腔后介质 (VPM) 中核神经元的多样性形态和连接模式. 一个新的工作流连接了神经元的形状,位置和连接,有助于thalamocortical电路研究.
科学领域:
- 神经科学是一个神经科学.
- 在Connectomics上,我们提供了连接.
- 计算生物学 计算生物学
背景情况:
- 了解thalamic神经元的多样性对于破译大脑中的感官信息处理至关重要.
- 完整的单个神经元重建为分析神经元连接提供了新的途径.
研究的目的:
- 描述257个腹腔后中核 (VPM) 中核神经元的形态和连接组的多样性.
- 开发一种新的工作流程,整合神经元地形,高阶连接和形态.
- 为VPM神经元数据和可视化工具建立一个统一的访问门户.
主要方法:
- 结合了MouseLight和Braintell项目对257个VPM神经元的数据.
- 基于目标皮层区域和轴突树不相似性的聚类神经元.
- 开发了一个2D嵌入来表示形态多样性,并得出了一个1D坐标.
主要成果:
- 一个1D坐标有效地捕捉了形态多样性,与 soma 和轴突末端位置相关联.
- 坐标也与增加的分支,距离 soma 的距离和分支宽度保持一致.
- 工作流成功地将VPM神经元拓,连接性和形态联系在一起.
结论:
- 一个新的工作流使神经元形态,地形和连接模式的整合成为可能.
- 开发的1D坐标提供了对VPM神经元多样性的定量测量.
- 工作流程和数据有助于建模和实验验证皮层连接的实验验证.
