在格鲁吉亚,比较用于有效监测和控制狂犬病的基因类型方法
Rene E Condori1, Natia Kartskhia2, Lasha Avaliani2
1Poxvirus and Rabies Branch, Division of High Consequence Pathogens and Pathology, National Center for Emerging and Zoonotic Infectious Disease, Centers for Disease Control and Prevention, Atlanta, GA, United States.
Frontiers in microbiology
|December 18, 2023
概括
在格鲁吉亚发现了两种不同的狗狂犬病类组,GEO_V1和GEO_V2. 安普利康测序为犬狂犬病的基因类型提供了一种快速,具有成本效益的方法,对全球根除努力至关重要.
科学领域:
- 兽医病毒学 兽医病毒学
- 分子流行病学分子流行病学
- 公共卫生 公共卫生
背景情况:
- 狂犬病仍然是一个重大的全球健康威胁,特别是在犬种群中.
- 狂犬病病毒的遗传特征对于有效的监测和控制策略至关重要.
研究的目的:
- 通过核蛋白 (N) 基因测序,从格鲁吉亚分离的狂犬病病毒进行遗传特征.
- 评估不同对狂犬病病毒遗传类型的测序方法.
- 评估使用安普利康序列测序用于狂犬病监测的可行性.
主要方法:
- 68个来自格鲁吉亚 (2015-2016) 的狂犬病病毒分离物的完整核蛋白 (N) 基因测序.
- 从泛lyssavirusRT-qPCR (LN34试验) 中分析部分N基因序列 (N-终端和C-终端) 和片序列.
- 遗传学分析以确定遗传关系并识别不同的族群.
主要成果:
- 确定了两个不同的狗狂犬病类组,GEO_V1和GEO_V2,在宇宙犬类中.
- GEO_V1分布广泛,有四个地理上重叠的亚族群; GEO_V2仅限于东南地区,与阿塞拜疆的孤立群相关.
- 所有四种测序方法都成功地区分了GEO_V1和GEO_V2,而遗传学结果受到序列长度的影响.
结论:
- 核蛋白基因测序有效地划分了犬种群中的狂犬病病毒遗传多样性.
- 对RT-qPCR阳性样本的安普利康测序是一种快速,具有成本效益的工具,用于狂犬病遗传类型.
- 通过基因类型的增强狂犬病监测可以显著促进犬狂犬病根除计划.
关键词:
在LN34测试试验中,狗狗的狂犬病 狗狗的狂犬病遗传多样性 遗传多样性分子流行病学分子流行病学狂犬病打字方式 狂犬病打字方式监控监督监督监督监督监督监督监督监督监督监督监督监督监督监督监督监督监督更多相关视频
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